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不可以，首次签注需要在人口窗口进行签注。自助签注机只能办理通行证的再次签注。

其他问答

内地居民可以单独申请往来港澳通行证但不申请签注吗?

内地居民可按需单独申领往来港澳通行证，无须同时申请签注。但实际前往港澳地区时，须办妥有效往来港澳通行证及赴港澳签注。

未成年人办理往来港澳通行证可以由监护人代办吗?可以不留存指纹信息吗?

未满16周岁的内地居民办理往来港澳通行证不可以代办，必须由监护人或监护人委托他人陪同申请;根据监护人意见，可以不采集16周岁以下申请人的指纹信息。